Meskipun hidup di air, ikan paus bukanlah ikan dan tidak bernapas menggunakan insang. Ikan paus adalah mamalia laut yang bernapas menggunakan paru-paru, sama seperti manusia. Mereka naik ke permukaan air untuk mengambil napas melalui lubang napas (blowhole) yang terletak di bagian atas kepala mereka.