Meskipun faktor-faktor seperti penjajahan, kesamaan budaya, dan keinginan untuk merdeka menjadi pendorong utama nasionalisme di Indonesia, ada pula faktor-faktor yang justru tidak berperan atau bahkan menghambat. Contohnya, perpecahan internal antaretnis atau kurangnya akses pendidikan yang merata dapat menghambat persatuan dan kesadaran nasional. Memahami faktor-faktor ini penting untuk memahami kompleksitas sejarah nasionalisme Indonesia.