Struktur organisasi yang baik sangat penting bagi usaha kecil makanan agar operasional berjalan lancar. Struktur sederhana biasanya terdiri dari pemilik/manajer, bagian produksi, bagian pemasaran, dan bagian keuangan. Pemilik/manajer bertanggung jawab atas strategi dan pengambilan keputusan. Bagian produksi fokus pada pembuatan produk, bagian pemasaran pada penjualan dan promosi, dan bagian keuangan pada pengelolaan keuangan. Setiap bagian memiliki peran penting dalam kesuksesan usaha.