Ambalan Pramuka Penegak memiliki struktur organisasi yang teratur untuk memastikan kegiatan berjalan lancar. Struktur ini terdiri dari Ketua Ambalan, Sekretaris, Bendahara, dan berbagai seksi yang menangani bidang-bidang tertentu seperti kegiatan, humas, dan perlengkapan. Setiap jabatan memiliki tugas dan tanggung jawab masing-masing, bekerja sama untuk mencapai tujuan Ambalan.