Rani Mukherjee menikah dengan sutradara dan produser film terkenal Bollywood, Aditya Chopra. Pernikahan mereka berlangsung secara tertutup di Italia pada tanggal 21 April 2014. Aditya Chopra merupakan pimpinan dari Yash Raj Films, salah satu rumah produksi film terbesar di India. Pasangan ini dikaruniai seorang putri bernama Adira, yang lahir pada tahun 2015.