Modifikasi Yamaha R25 ala MotoGP adalah cara populer untuk meningkatkan tampilan motor agar lebih sporty dan agresif. Beberapa perubahan umum meliputi penggunaan fairing custom, penggantian knalpot racing, pemasangan footstep underbone, dan pengecatan dengan livery tim MotoGP. Modifikasi ini tidak hanya meningkatkan estetika, tetapi juga performa motor.