Flora Indonesia bagian Barat dan Timur sangat berbeda karena faktor geografis, iklim, dan sejarah evolusi. Wilayah Barat, seperti Sumatera dan Jawa, didominasi oleh hutan hujan tropis dengan keanekaragaman hayati tinggi yang mirip dengan flora Asia. Sementara itu, wilayah Timur, seperti Papua, memiliki flora yang lebih mirip dengan Australia, dengan banyak spesies endemik yang unik. Perbedaan curah hujan, jenis tanah, dan isolasi geografis telah berkontribusi pada keragaman flora yang mencolok antara kedua wilayah ini.