Runtuhnya Kerajaan Kalingga disebabkan oleh berbagai faktor kompleks. Secara politik, kurangnya stabilitas internal dan persaingan dengan kerajaan lain melemahkan Kalingga. Secara ekonomi, perubahan jalur perdagangan dan berkurangnya sumber daya turut berkontribusi. Faktor sosial seperti konflik internal dan tekanan dari kerajaan lain juga memainkan peran penting dalam keruntuhan kerajaan ini.