Kemunduran Kerajaan Kalingga disebabkan oleh beberapa faktor kompleks. Konflik internal perebutan kekuasaan, perubahan jalur perdagangan, dan tekanan dari kerajaan-kerajaan tetangga seperti Sriwijaya memainkan peran penting. Selain itu, perubahan sosial dan ekonomi juga berkontribusi pada melemahnya kerajaan ini, yang akhirnya berujung pada kemunduran dan hilangnya pengaruh Kalingga di Nusantara.