Mesoterapi, seperti prosedur medis lainnya, dapat menimbulkan efek samping. Oleh karena itu, monitoring efek samping obat yang digunakan sangat penting untuk memastikan keamanan pasien. Efek samping yang mungkin timbul antara lain reaksi alergi, infeksi, dan perubahan pigmentasi kulit. Dengan memonitor secara cermat, dokter dapat segera mengambil tindakan yang diperlukan untuk mengatasi efek samping dan mencegah komplikasi yang lebih serius.