Lion Air menggunakan terminal yang berbeda-beda di berbagai bandara di Indonesia. Di Bandara Soekarno-Hatta (CGK), Lion Air umumnya beroperasi dari Terminal 1A untuk penerbangan domestik. Namun, penting untuk selalu memeriksa tiket dan papan informasi bandara untuk memastikan terminal keberangkatan yang tepat, karena terkadang terjadi perubahan. Untuk bandara lain, seperti Juanda (SUB) atau Ngurah Rai (DPS), terminal Lion Air juga bisa berbeda. Selalu konfirmasikan informasi ini sebelum menuju bandara untuk menghindari keterlambatan.