Kongres Kedua Budi Utomo diadakan di Yogyakarta pada tanggal 10-11 Oktober 1909. Tujuan utama kongres ini adalah untuk merumuskan arah perjuangan organisasi Budi Utomo dalam meningkatkan kesejahteraan dan pendidikan masyarakat pribumi. Salah satu hasil penting dari kongres ini adalah pengangkatan Radjiman Wediodiningrat sebagai ketua Budi Utomo, menggantikan pendiri sebelumnya.