Bakteri memiliki struktur sel yang unik dan berbeda dari sel eukariotik. Struktur utama bakteri meliputi dinding sel yang memberikan perlindungan dan bentuk, membran plasma yang mengatur keluar masuknya zat, ribosom untuk sintesis protein, DNA yang menyimpan informasi genetik, serta berbagai organel lainnya yang memiliki fungsi spesifik dalam mendukung kehidupan bakteri.