Viroid dan prion adalah agen infeksius yang berbeda dari virus. Viroid adalah molekul RNA telanjang yang menginfeksi tumbuhan, sedangkan prion adalah protein yang dapat menyebabkan penyakit neurodegeneratif pada hewan dan manusia. Viroid bereplikasi menggunakan enzim inang, sementara prion menyebabkan protein normal berubah bentuk menjadi prion juga. Meskipun keduanya berukuran kecil, viroid dan prion memiliki mekanisme infeksi yang berbeda dan menyebabkan penyakit yang berbeda pula.