Denah laboratorium kultur jaringan yang baik harus mempertimbangkan alur kerja yang efisien dan meminimalkan risiko kontaminasi. Biasanya, laboratorium kultur jaringan dibagi menjadi beberapa ruang, termasuk ruang persiapan media, ruang transfer, ruang inkubasi, dan ruang sterilisasi. Setiap ruang harus dilengkapi dengan peralatan yang sesuai, seperti autoclave, laminar air flow, inkubator, dan mikroskop. Tata letak yang baik akan memastikan alur kerja yang lancar dan lingkungan yang steril untuk keberhasilan kultur jaringan.