Meskipun kolang kaling memiliki banyak manfaat kesehatan, seperti kandungan serat yang tinggi dan membantu pencernaan, konsumsi berlebihan dapat menyebabkan efek samping tertentu. Beberapa orang mungkin mengalami masalah pencernaan seperti kembung atau diare jika mengonsumsi kolang kaling dalam jumlah besar. Selain itu, perlu diperhatikan juga kandungan gula tambahan dalam kolang kaling yang telah diolah atau dimaniskan, karena konsumsi gula berlebihan dapat berdampak negatif pada kesehatan.