Membedakan ayam mutiara jantan dan betina bisa dilakukan dengan memperhatikan beberapa ciri fisik, suara, dan perilaku. Ayam mutiara jantan umumnya memiliki ukuran tubuh yang lebih besar dan jengger yang lebih menonjol dibandingkan betina. Selain itu, suara ayam mutiara jantan biasanya lebih nyaring dan sering berkokok, sementara betina lebih sering mengeluarkan suara 'tok-tok'. Perilaku agresif juga lebih sering terlihat pada ayam mutiara jantan.