Membedakan anak ayam mutiara jantan dan betina bisa menjadi tantangan tersendiri, terutama saat usia mereka masih sangat muda. Beberapa metode tradisional yang sering digunakan meliputi pengamatan pada bentuk kepala, ukuran tubuh, dan perilaku. Anak ayam mutiara jantan cenderung memiliki ukuran tubuh yang sedikit lebih besar dan kepala yang lebih tegak dibandingkan betina. Perilaku juga bisa menjadi indikasi, di mana jantan biasanya lebih aktif dan agresif. Namun, untuk hasil yang lebih akurat, sebaiknya tunggu hingga usia ayam mutiara mencapai beberapa minggu atau bulan, di mana perbedaan fisik akan lebih jelas terlihat.