Memasak misoa membutuhkan perhatian khusus agar tidak lembek. Caranya adalah dengan merebus air hingga mendidih, lalu masukkan misoa sebentar saja (sekitar 1-2 menit). Segera angkat dan tiriskan. Siram dengan air dingin untuk menghentikan proses pemasakan. Misoa siap diolah menjadi berbagai masakan.