Biji rambutan termasuk dalam kelompok tumbuhan dikotil (dicotyledoneae). Hal ini ditunjukkan dengan adanya dua kotiledon atau daun lembaga pada biji rambutan. Selain itu, tumbuhan dikotil biasanya memiliki ciri-ciri lain seperti akar tunggang, batang bercabang, dan tulang daun menjari atau menyirip. Rambutan memenuhi semua karakteristik tersebut sehingga diklasifikasikan sebagai tumbuhan dikotil.