Vakuola pada sel hewan memiliki fungsi yang bervariasi tergantung jenis selnya, namun secara umum, perannya tidak sebesar pada sel tumbuhan. Beberapa fungsi vakuola pada sel hewan adalah menyimpan air, nutrisi, dan zat sisa, serta membantu dalam proses eksositosis dan endositosis. Pada beberapa sel hewan, vakuola juga dapat berperan dalam menjaga tekanan turgor dan mendukung struktur sel.