Peta Indonesia menggunakan berbagai warna untuk merepresentasikan informasi geografis yang berbeda. Warna biru biasanya digunakan untuk menggambarkan perairan seperti laut, sungai, dan danau. Warna hijau menunjukkan dataran rendah atau wilayah dengan vegetasi yang lebat. Warna kuning dan coklat digunakan untuk menunjukkan ketinggian daratan, dengan warna coklat semakin tua menunjukkan ketinggian yang semakin tinggi. Warna putih sering digunakan untuk menunjukkan daerah yang tertutup salju atau es. Selain itu, warna lain seperti merah dan hitam dapat digunakan untuk menunjukkan informasi khusus seperti jalan, batas wilayah, atau lokasi penting.