Kerajaan Kalingga runtuh karena kombinasi faktor internal dan eksternal. Konflik politik perebutan kekuasaan melemahkan stabilitas internal. Disamping itu, tekanan ekonomi dari kerajaan lain, dan perubahan jalur perdagangan juga turut berkontribusi. Faktor sosial seperti bencana alam mungkin juga mempercepat kemunduran Kalingga.